De AlphaFold-databank heeft miljoenen nieuwe door kunstmatige intelligentie (AI) voorspelde 3D-structuren van eiwitcomplexen van de mens en zijn ziekteverwekkers openbaar beschikbaar gesteld voor onderzoek. Het betreft eiwitstructuren van twintig soorten die staan op de lijst van de World Health Organisation van bacteriële pathogenen, waaronder Salmonella-, Shigella-, Neisseria-, Pseudomonas- en Staphylococcus-soorten. De openstelling en democratisering van de databank komt voort uit een nieuwe samenwerking tussen het European Bioinformatics Institute (EBI-EMBL), Google DeepMind, NVIDIA en Seoul National University. ‘Door deze fundamentele dataset van eiwitcomplexen openbaar beschikbaar te stellen aan de wereld, nodigen we onderzoekers uit om deze te testen, te verfijnen en erop voort te bouwen, om zo de volgende golf van biologische ontdekkingen te stimuleren’, stelt EBI-intrim-directeur Jo McEntyre 16 maart in een persbericht.
De AlphaFold-databank komt voort uit een in 2021 door Google DeepMind opgezet AI-systeem, waarvoor John Jumper en Demis Hassabis in 2024 de Nobelprijs voor Chemie ontvingen. Het omvat momenteel de grootste dataset met beschikbare voorspellingen van eiwitcomplexen en kent al meer dan 3,4 miljoen gebruikers uit 190 landen. Dankzij de databank kunnen wetenschappers eiwitinteracties visualiseren en zo de moleculaire mechanismen ontrafelen die celgedrag en ziekten aansturen. Dit maakt het onder meer mogelijk nieuwe vaccins, medicijnen en therapieën te ontwikkelen. Het consortium hoopt met de nieuwe uitbreiding en openstelling een ‘golf van ontdekkingen in gang te zetten, die uiteindelijk de menselijke gezondheid op wereldwijde schaal kunnen verbeteren.’