Computersimulatie van complete celcyclus

Deel

Het is Amerikaanse onderzoekers gelukt een computersimulatie te maken van de gehele levenscyclus van een minimale cel. Met verschillende algoritmen en nieuwe computationele methoden weten ze van elk molecuul in de digitale cel het gedrag te bepalen, zo schrijven de Amerikanen in Cell van 9 maart. Op die manier kunnen ze onder meer dna-replicatie, eiwittranslatie, het ontstaan van ribosomen en celsplitsing simuleren.


De digitale cel is gemodelleerd naar een aangepaste bacterie, JCVI-syn3A. Deze bacterie bevat slechts vijfhonderd genen; net genoeg om te kunnen groeien, splitsen en basisfuncties van een cel te vervullen. Waar het origineel een celsplitsing in een kleine twee uur voltooit, doet de computerversie daar zo’n zes dagen over, vanwege de vele berekeningen die hierbij nodig zijn.

Gesimuleerde cel in vroege fase van celsplitsing. Links: membraan in groen, ribosomen in geel en paars, chromosomen in rood. Rechts: eiwitten in grijs, rna in oranje en in het midden een doorkijkje naar gekopieerde chromosomen in blauw. Credit: Zane Thornburg

Lees nu ook